Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gtf3c6Q9D8P7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c6Q9D8P7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c6Q9D8P7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c6Q9D8P7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c6Q9D8P7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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