Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c55Q9D816 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c55Q9D816 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c55Q9D816 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c55Q9D816 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c55Q9D816 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c55Q9D816 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c55Q9D816 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms