Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ca13Q9D6N1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ca13Q9D6N1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ca13Q9D6N1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ca13Q9D6N1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ca13Q9D6N1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ca13Q9D6N1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms