Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Necab3Q9D6J4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Necab3Q9D6J4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Necab3Q9D6J4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Necab3Q9D6J4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Necab3Q9D6J4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab3Q9D6J4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Necab3Q9D6J4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab3Q9D6J4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab3Q9D6J4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Necab3Q9D6J4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Necab3Q9D6J4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms