Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930564D02RikQ9D4S4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930564D02RikQ9D4S4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930564D02RikQ9D4S4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930564D02RikQ9D4S4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930564D02RikQ9D4S4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930564D02RikQ9D4S4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms