Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubgcp4Q9D4F8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp4Q9D4F8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubgcp4Q9D4F8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp4Q9D4F8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubgcp4Q9D4F8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms