Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam90a1bQ9D4F3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam90a1bQ9D4F3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms