Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UvssaQ9D479 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UvssaQ9D479 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UvssaQ9D479 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UvssaQ9D479 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UvssaQ9D479 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
UvssaQ9D479 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UvssaQ9D479 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms