Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam227aQ9D3V8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam227aQ9D3V8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam227aQ9D3V8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam227aQ9D3V8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam227aQ9D3V8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam227aQ9D3V8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam227aQ9D3V8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam227aQ9D3V8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam227aQ9D3V8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms