Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf128Q9D304 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf128Q9D304 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf128Q9D304 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf128Q9D304 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf128Q9D304 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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