Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lsm12Q9D0R8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsm12Q9D0R8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lsm12Q9D0R8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lsm12Q9D0R8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms