Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx17Q9D0I4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx17Q9D0I4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx17Q9D0I4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx17Q9D0I4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms