Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2v1Q9CZY3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ube2v1Q9CZY3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2v1Q9CZY3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2v1Q9CZY3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms