Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChtopQ9CY57 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChtopQ9CY57 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChtopQ9CY57 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChtopQ9CY57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms