Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl11Q9CXW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl11Q9CXW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl11Q9CXW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl11Q9CXW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms