Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Malsu1Q9CWV0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Malsu1Q9CWV0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Malsu1Q9CWV0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Malsu1Q9CWV0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms