Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
2310003L06RikQ9CV82 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2310003L06RikQ9CV82 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2310003L06RikQ9CV82 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2310003L06RikQ9CV82 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310003L06RikQ9CV82 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310003L06RikQ9CV82 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms