Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930553M12RikQ9CUH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930553M12RikQ9CUH1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930553M12RikQ9CUH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms