Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud1Q9CUB6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud1Q9CUB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Otud1Q9CUB6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otud1Q9CUB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud1Q9CUB6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud1Q9CUB6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms