Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC8

Lrrc40, Leucine-rich repeat-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc40Q9CRC8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc40Q9CRC8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc40Q9CRC8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc40Q9CRC8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc40Q9CRC8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc40Q9CRC8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc40Q9CRC8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc40Q9CRC8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc40Q9CRC8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc40Q9CRC8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc40Q9CRC8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc40Q9CRC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms