Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd9Q9CR00 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd9Q9CR00 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd9Q9CR00 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms