Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PsenenQ9CQR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PsenenQ9CQR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PsenenQ9CQR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PsenenQ9CQR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms