Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl41Q9CQN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl41Q9CQN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl41Q9CQN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl41Q9CQN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl41Q9CQN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms