Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd2aQ9CQJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd2aQ9CQJ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd2aQ9CQJ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd2aQ9CQJ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms