Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpb2Q9CQI7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpb2Q9CQI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpb2Q9CQI7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrpb2Q9CQI7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpb2Q9CQI7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms