Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc18Q9CQ07 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc18Q9CQ07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc18Q9CQ07 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms