Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsnaxip1Q99P25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsnaxip1Q99P25 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsnaxip1Q99P25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsnaxip1Q99P25 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tsnaxip1Q99P25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.7 ms