Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3b1Q99NB9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sf3b1Q99NB9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b1Q99NB9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b1Q99NB9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b1Q99NB9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3b1Q99NB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b1Q99NB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sf3b1Q99NB9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b1Q99NB9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b1Q99NB9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms