Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PtprtQ99M80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PtprtQ99M80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PtprtQ99M80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PtprtQ99M80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PtprtQ99M80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PtprtQ99M80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PtprtQ99M80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PtprtQ99M80 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PtprtQ99M80 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PtprtQ99M80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PtprtQ99M80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PtprtQ99M80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PtprtQ99M80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
PtprtQ99M80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PtprtQ99M80 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PtprtQ99M80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprtQ99M80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprtQ99M80 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PtprtQ99M80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
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