Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL5

Pwp1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pwp1Q99LL5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pwp1Q99LL5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pwp1Q99LL5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pwp1Q99LL5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pwp1Q99LL5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pwp1Q99LL5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pwp1Q99LL5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pwp1Q99LL5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pwp1Q99LL5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pwp1Q99LL5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pwp1Q99LL5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms