Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp16Q99LG0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp16Q99LG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp16Q99LG0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp16Q99LG0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp16Q99LG0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp16Q99LG0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Usp16Q99LG0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Usp16Q99LG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Usp16Q99LG0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Usp16Q99LG0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Usp16Q99LG0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Usp16Q99LG0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp16Q99LG0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Usp16Q99LG0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms