Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SmagpQ99KC7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SmagpQ99KC7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SmagpQ99KC7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms