Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc33a1Q99J27 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc33a1Q99J27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc33a1Q99J27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc33a1Q99J27 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms