Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubb6Q922F4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb6Q922F4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Tubb6Q922F4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tubb6Q922F4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubb6Q922F4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb6Q922F4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb6Q922F4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms