Protein–RNA interactions for Protein: Q922D4

Ppp6r3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r3Q922D4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp6r3Q922D4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp6r3Q922D4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppp6r3Q922D4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp6r3Q922D4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp6r3Q922D4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp6r3Q922D4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppp6r3Q922D4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp6r3Q922D4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms