Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms