Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcdhb12Q91Y07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcdhb12Q91Y07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcdhb12Q91Y07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdhb12Q91Y07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcdhb12Q91Y07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcdhb12Q91Y07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdhb12Q91Y07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdhb12Q91Y07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pcdhb12Q91Y07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcdhb12Q91Y07 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms