Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lims2Q91XD2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lims2Q91XD2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lims2Q91XD2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lims2Q91XD2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lims2Q91XD2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lims2Q91XD2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms