Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chrna2Q91X60 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chrna2Q91X60 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chrna2Q91X60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chrna2Q91X60 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chrna2Q91X60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chrna2Q91X60 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Chrna2Q91X60 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chrna2Q91X60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna2Q91X60 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chrna2Q91X60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chrna2Q91X60 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna2Q91X60 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna2Q91X60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna2Q91X60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna2Q91X60 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms