Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SelenomQ8VHC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SelenomQ8VHC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SelenomQ8VHC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SelenomQ8VHC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms