Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmcd1Q8VEE1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmcd1Q8VEE1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmcd1Q8VEE1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmcd1Q8VEE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmcd1Q8VEE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmcd1Q8VEE1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmcd1Q8VEE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms