Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol9aQ8VDU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apol9aQ8VDU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol9aQ8VDU3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol9aQ8VDU3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms