Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5H1

Usp15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp15Q8R5H1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp15Q8R5H1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp15Q8R5H1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp15Q8R5H1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp15Q8R5H1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp15Q8R5H1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp15Q8R5H1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp15Q8R5H1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp15Q8R5H1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp15Q8R5H1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp15Q8R5H1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp15Q8R5H1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms