Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4H2

Arhgef12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef12Q8R4H2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Arhgef12Q8R4H2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Arhgef12Q8R4H2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Arhgef12Q8R4H2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Arhgef12Q8R4H2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Arhgef12Q8R4H2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Arhgef12Q8R4H2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Arhgef12Q8R4H2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Arhgef12Q8R4H2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Arhgef12Q8R4H2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Arhgef12Q8R4H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms