Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc12Q8R344 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc12Q8R344 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc12Q8R344 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc12Q8R344 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc12Q8R344 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc12Q8R344 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms