Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup58Q8R332 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nup58Q8R332 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup58Q8R332 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup58Q8R332 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup58Q8R332 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms