Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps37bQ8R0J7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps37bQ8R0J7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps37bQ8R0J7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps37bQ8R0J7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps37bQ8R0J7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps37bQ8R0J7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms