Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B2

Mcfd2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcfd2Q8K5B2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mcfd2Q8K5B2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mcfd2Q8K5B2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mcfd2Q8K5B2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mcfd2Q8K5B2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mcfd2Q8K5B2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms