Protein–RNA interactions for Protein: Q8K572

Hus1b, Checkpoint protein HUS1B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hus1bQ8K572 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hus1bQ8K572 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hus1bQ8K572 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hus1bQ8K572 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hus1bQ8K572 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hus1bQ8K572 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms