Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Colec12Q8K4Q8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Colec12Q8K4Q8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Colec12Q8K4Q8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Colec12Q8K4Q8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Colec12Q8K4Q8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colec12Q8K4Q8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms